- la majorité des sites sont seulement inventoriés, c'est à dire décrits par leurs caractères écologiques (faune, flore, habitats naturels…) et délimités géographiquement (périmètre dessiné sur carte). Mais ces ENS ne bénéficient d'aucune mesure de protection ou de valorisation.

- Parmi les ENS inventoriés, certains sites prioritaires sont choisis pour faire l’objet de démarches de protection. Ces sites sont appelés « ENS d’intervention ». Parmi eux, une soixantaine de site sont protégés grâce à la politique départementale dédiée aux ENS. Ces sites, contrairement aux ENS simplement inventoriés, bénéficient d’une protection et d’une gestion durables mises en œuvre par un organisme compétent pour la préservation des milieux naturels. La mission de l’organisme gestionnaire consiste à assurer le maintien et le développement des espèces remarquables et des milieux naturels. Certains d’entre eux sont également mis en valeur et aménagés pour l’accueil du public.